Vejen har navn efter Ny Bakkegård, der lå overfor Gammel Bakkehus på Rahbeks Allé.
Der var også en Gammel Bakkegård, der lå på hjørnet af Valby Langgade og Ny Carlsbergvej, som den gang hed Bakkegårdsvej.
Gården opstod omkring 1800 som et landsted opført af Knud Engelbrecht Langberg. Det blev senere overtaget af konseilspræsident Carl Christian Hall (1812-1888), der har givet navn til Halls Allé. En ny hovedbygning blev opført i 1840.
En del af ejendommen eksisterer stadig, men med adressen Rahbeks Allé 34 (herunder).
Bakkegårds Allé blev anlagt som vej i 1890’erne
