Mange gader på Østerbro har navne efter danske provinsbyer.
Vejen hed oprindeligt Batterivej og blev anlagt i 1860’erne som forbindelsesvej til Kalkbrænderi Batteri, der var bygget som en del af Københavns søbefæstning omkring 1860.
I 1886 fik Viborggade sit nuværende navn.
Viborggades vestlige del var præget af ejendomme med lejligheder, som var mindre end det normale for Østerbro.
Gadens østlige del har haft flere industrivirksomheder. I Viborggade 70 lå et kalkværk med en stor ringovn. Den forsvandt i 1896, og Københavns Smergelfabrik (billedet herunder) overtog grunden.
Øst for Silkeborggade lå virksomheden August Neuberts Bomuldsvæveri, der var grundlagt omkring 1860. Senere blev arealet brugt af stearinlysfabrikken Pia Lys, der dog brændte ned i 1982. Derefter blev det nuværende etagebyggeri – Pia Hus – opført på grunden.