På det nordligste Amager lå i 1700- og 1800-tallet flere vindmøller.
Store Mølle stod indtil ca. 1789 på Christianshavns Vold og var oprindeligt en stubmølle. Dens navn skal nok ses i relation til Lille Mølle, der stadig står på volden.
Møllen lå et stykke fra Amagerbrogade og til møllen hørte en beboelsesbygning og stald.
I 1830 blev den overtaget af tobaksfabrikant Carl Christian Augustinus.
1844 nedbrændte Store Mølle, men den blev genopført. Nu blev den en hollandsk mølle, altså en mølle, hvor kun hatten og vingerne drejer efter vinden.
Møllen var én af landets største med et vingefang på 25 meter.
Efter genopførelsen blev der også bygget en lang, toetages fabriksbygning i tilknytning til møllen, der nu fungerede som dampmølle.
Dampmaskinen var leveret af skibsbyggeriet Burmeister & Wain på Christianshavn. Vandet til produktionen af damp, kom fra voldgraven tæt ved.
Møllen lå indenfor den militære beskyttelseszone på det nordlige Amager, og skulle derfor kunne nedrives.
I 1864 købte Lauritz Peter Holmblad møllen, og hans søn Jacob flyttede ind i møllebygningen.
Den var stadig en traditionel kornmølle, men blev nu også en fabrik for produktion af sæbe, belysningsolier og stearinlys.
I 1880 brændte både møllen og fabrikken. Branden opstod heldigvis i arbejdernes frokostpause, så ingen kom noget til, men lageret af råmaterialer til bl.a. lysfabrikationen god næring til ilden. Brandvæsenet forsøgte forgæves med fem brandsprøjter at slukke ilden.
Fabrikationen af stearinlys blev flyttet til en anden af Holmblads fabrikker, og selve møllen – der formentlig ikke var helt beskadiget – blev nedtaget og flyttet til Taastrup ved Fakse. Her fortsatte den under navnet ”Storemøllen”.
De resterende bygninger blev nu brugt som sæbesyderi.
Holmblad havde tidligere haft en sæbefabrikation i Store Regnegade, og herfra blev der flyttet en stentavle med inskriptionen ”Kongel. Allernaadigst Privilligeret Sæbesyderi” og årstallet 1761. Det fik nogen til at tro, at møllen var grundlagt på Amager det år.
1907 overtog ejendomsselskabet Amagerbro A/S bygningerne og udlejede dem til Mejeriet Perfect, mens grunden blev udlejet til et gartneri.
Mejeriet var startet som et forsøgsmejeri for Burmeister & Wains skibsværft, der fremstillede centrifuger til mejerierne. Der var også et lille mejeriudsalg i gården.
1916 blev villabygningen mod Amagerbrogade nedrevet, mens fabriksbygningerne først forsvandt i 1936.
Hvor møllens bygning lå, blev der bygget en badmintonhal.
Den nuværende bebyggelse langs Store Møllevej er opført i anden halvdel af 1920’erne.