Vejen har formentlig sit navn efter en vindmøllepark, der er i 1996 blev etableret ved Lynetten på Refshaleøen.
Vindmøllevej er adgangsvej til affaldsforbrændingsanlægget Amager Bakke, der drives af Amager Ressource Center. (tidligere Amagerforbrænding). Anlægget er tegnet af arkitektfirmaet BIG og åbnede i 2017.
Amager Bakke erstattede én af blokkene på naboen Amagerværket og kan forbrænde 400.000 affald om året.
Værket er Københavns højeste bygning. Skorstenen er 123 meter høj.
Amager Bakke er samtidig et rekreativt anlæg, hvor man kan klatre, stå på ski på kunststofunderlag og bestige den 85 meter høje bygning.
