Strædet har navn efter Sankt Petri Kirke.
Flere huse i Sankt Peders Stræde har haft tilknytning til kirken. I nr. 3 lå kirkens drengeskole og i nr. pigeskolen.
I Sankt Peders Stræde 9 var der boliger for kirkens kantor (leder af koret) og graver.
I Sankt Peders Stræde lå flere huse, som var boliger for kannikerne ved Vor Frue Kirke.
Efter reformationen blev de overtaget af Københavns Universitet.
Den blev overtaget af Den polytekniske læreanstalt, der startede sin undervisning af ingeniører i bygningen og i grundlæggeren Hans Christian Ørsteds private bolig i Studiestræde.
I gården mellem de to gader lå bl.a. anstaltens kemilaboratorium, hvor Ørsted fremstillede aluminium for første gang.
Senere har universitetet brugt bygningen til bl.a. det juridiske fakultet, som nu er flyttet til Ørestad.
Ved siden af ligger det såkaldte universitetsanneks (herunder), som dels blev opført i 1860 og del i 1915-1916 med Martin Borch (1852-1937) som arkitekt. Bygningskomplekset ligger også med en fløj i Studiestræde.
I Sankt Peders Stræde 14 ligger Valkendorffs Kollegium.
Kollegiet har sin oprindelse i 1519, hvor det var beboet af karmelittermunke, der underviste i teologi. Det var det første af sin art i Norden.
Det blev senere i 1500-tallet overtaget af rigets hovmester, Christoffer Valkendorf, som det blev opkaldt efter.
På kollegiet har der boet en række forfattere, f.eks. Johannes Ewald, Steen Steensen Blicher og Herman Bang.
Kollegiets oprindelige bygning blev i 1865 erstattet af den nuværende (herover), som blev trukket tilbage fra gaden og i dag ligger lidt gemt i haven.
Bygningen er tegnet af arkitekten Christian Hansen (1808-1883). På facaden sidder slægten Valkendorffs våben (herunder).
I Sankt Peders Stræde 12 blev omkring 1740 opført det såkaldte Budolfi Kloster. som var en stiftelse for ti uformuende kvinder af god familie. Stiftelsen fungerede frem til 1936.
Den nuværende bygning i nr. 12 (herover) er opført til Frederik den VI’s Asyl, som er det ene af fire børneasyler, der blev oprettet af Det Københavnske Asylselskab i 1830’erne.
Asylet blev stiftet til minde om kong Frederik den 6., og blev understøttet af hans dronning Caroline Amalie. Det var formentlig hende, der opfordrede salmedigterne B. S. Ingemann til at skrive sange til børn, f.eks. “Nu titte til hinanden”.
Asylet lå oprindeligt i Larslejstræde, men flyttede hertil i 1937, og er fortsat en institution for børn i alderen 0-6 år.
Den mønstrede bygning i Sankt Peders Stræde 19 (herover) blev opført i 1884 for institutionen Sankt Peders Gæstehjem. Det tilbød kost og logi for tilrejsende arbejdere og håndværkere. Hjemmet ophørte i 1910 og bygningen blev senere overtaget af universitetet.
Tidligere lå der flere små industrivirksomheder i Sankt Peders Stræde. Her lå f.eks. en tapetfabrik, en vatfabrik og T. C. Naylors file- og stålfabrik.
Den meget moderne udseende ejendom i Sankt Peders Stræde 34-36 (herunder) er opført i 1910. Arkitekten var Axel Preisler (1871-1930).
