Vejen har navn efter Ny Bakkegård, der lå overfor Gammel Bakkehus på Rahbeks Allé.
Der var også en Gammel Bakkegård, der lå på hjørnet af >Valby Langgade og >Ny Carlsbergvej, som den gang hed Bakkegårdsvej.
Gården opstod omkring 1800, konseilspræsident Carl Christian Hall (1812-1888), der har givet navn til Halls Allé, opførte en ny hovedbygning i 1840.
En del af ejendommen eksisterer stadig på Rahbeks Allé 3
Bakkegårds Allé blev anlagt som vej i 1893.
