Vejen har navn efter Ny Bakkegård, der lå overfor Gammel Bakkehus på Rahbeks Allé.

Der var også en Gammel Bakkegård, der lå på hjørnet af >Valby Langgade og >Ny Carlsbergvej, som den gang hed Bakkegårdsvej.

Gården opstod omkring 1800, konseilspræsident Carl Christian Hall (1812-1888), der har givet navn til Halls Allé, opførte en ny hovedbygning i 1840.

En del af ejendommen eksisterer stadig på Rahbeks Allé 3

Bakkegårds Allé blev anlagt som vej i 1893.